2021年6月24日
分子动力学（MD）模拟研究了蒽（ANT）在三种CD（即β-CD、HP-β-CD和SBE-β-CD）中的包容行为。MD结果表明，ANT可以自发地进入这三种CD的空腔中。不同的是，ANT只能从SBE-β-CD的宽边缘进入其空腔。然后，通过分析每种CD的葡萄糖单元的结构畸变，研究了取代基2-羟基丙基（HP）和磺化丁基（SBE）对CD结构的影响。结果发现，中性的β-CD呈现出圆锥形结构，而HP或SBE基团的存在对结构的影响很大。由于取代基团的波动引起的葡萄糖单元的翻转，二级边缘会变窄。当ANT被包含在空腔内时，三个CD的空腔构象得到了一定程度的恢复。同时，取代基团沿空腔轴线延伸并与客体分子相互作用。通过分析每个CD和ANT之间的相互作用，发现取代基团扩大了疏水性空腔的体积。取代基团和
葡萄糖单元都会对与客体分子的相互作用做出贡献。CD环的构象变化导致空腔的收缩，这可能导致与ANT分子的紧密结合。
该手稿用漂亮的计算机图形说明了复合物的构象。
Yan X, Wang Y, Meng T and Yan H (2021) Computational Insights Into the Influence of Substitution Groups on the Inclusion Complexation of β-Cyclodextrin. Front. Chem. 9:668400.
doi: 10.3389/fchem.2021.668400
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