2020年10月9日
計算ツールのセットは、汎用性の高いインフォマティクスツールボックスの開発と実装を介して複雑な炭水化物を正確に表現することを可能にするコミュニティの優れた貢献を表している。これらの正当な努力は、科学コミュニティ内でのコミュニケーションを促進することを目的としている。いくつかの利用可能なアプリケーションの比較分析を確立するために、17の選択された項目が評価された。ツールの比較分析は、糖鎖生物学者や、糖鎖の描画、構築、表示のためのすぐに使用できる、シンプルなアプリケーションを探しているすべての研究者にとって有用となる可能性がある。この記事では、糖鎖の描画、構築、表示のために利用できる計算ツールとリソースの概要が示されている。また、最近開発された糖鎖と糖質に特化したソフトウェアツールの説明的分析も示されている。新しく開発されたツールは、より高度なものであり、グリカン表現のための標準的な命名法とシンボルを使用している。これらのツールは、研究、コミュニケーション、データベースにおける糖鎖の記述を標準化にさらに役立つものとなる。
Kanhaya Lal, Rafael Bermeo, Serge Perez: Computational tools for drawing, building and displaying carbohydrates: a visual guide. Beilstein Journal of Organic Chemistry 2020, 16, 2448-2468 https://www.beilstein-journals.org/bjoc/content/pdf/1860-5397-16-199.pdf?a=y
コメント